cellxgene-census

K-Dense-AI/scientific-agent-skills/skills/cellxgene-census

查询 CZ CELLxGENE Census 程序化获取版本化公共单细胞和空间转录组数据

Queries the CZ CELLxGENE Census programmatically for versioned public single-cell and spatial transcriptomics data. Use when you need population-scale cell metadata, gene expression slices, Census summary counts, source H5AD URIs/downloads, embeddings, spatial Census data, or reference atlas comparisons across organisms, tissues, diseases, assays, and cell types. For analyzing your own local single-cell data use scanpy, anndata, or scvi-tools.

把下面的话发给 Claude Code、Codex 或 Cursor。智能体会先检查内容，经你确认再安装。

请帮我安装这个 Agent Skill：https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/main/skills/cellxgene-census

1. 先读取该目录下的 SKILL.md 和其他文件，检查是否有可疑内容（执行未知脚本、读取密钥、向外发送数据等），用中文告诉我它会做什么、需要哪些权限；
2. 等我确认后，再把整个目录安装到 ~/.claude/skills/cellxgene-census/（如果你不是 Claude Code，安装到你自己约定的 skills 目录）；
3. 安装后告诉我怎么触发它。

安装到个人 Skill 目录（对所有项目生效）。只想在当前项目用，改为 .claude/skills/。

git clone --depth 1 --filter=blob:none --sparse https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/cellxgene-census-src
cd /tmp/cellxgene-census-src && git sparse-checkout set "skills/cellxgene-census"
mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r "skills/cellxgene-census" ~/.claude/skills/cellxgene-census

Skill 可以让智能体执行脚本。安装第三方 Skill 前务必看一遍内容，详见「安全」一课。

SKILL.md

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