etetoolkit

K-Dense-AI/scientific-agent-skills/skills/etetoolkit

分析比较系统发育树支持 Newick 格式拓扑编辑 Robinson-Foulds 比较可视化

Analyzes, manipulates, compares, annotates, and visualizes phylogenetic or other hierarchical trees with ETE 4. Supports Newick/Nexus tree I/O, topology edits and pattern matching, Robinson-Foulds comparisons, gene-tree evolutionary events and reconciliation, NCBI/GTDB taxonomy, SmartView exploration, and publication rendering. Applies to existing trees after alignment and phylogenetic inference, rather than inferring trees from raw sequences.

把下面的话发给 Claude Code、Codex 或 Cursor。智能体会先检查内容，经你确认再安装。

请帮我安装这个 Agent Skill：https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/main/skills/etetoolkit

1. 先读取该目录下的 SKILL.md 和其他文件，检查是否有可疑内容（执行未知脚本、读取密钥、向外发送数据等），用中文告诉我它会做什么、需要哪些权限；
2. 等我确认后，再把整个目录安装到 ~/.claude/skills/etetoolkit/（如果你不是 Claude Code，安装到你自己约定的 skills 目录）；
3. 安装后告诉我怎么触发它。

安装到个人 Skill 目录（对所有项目生效）。只想在当前项目用，改为 .claude/skills/。

git clone --depth 1 --filter=blob:none --sparse https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/etetoolkit-src
cd /tmp/etetoolkit-src && git sparse-checkout set "skills/etetoolkit"
mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r "skills/etetoolkit" ~/.claude/skills/etetoolkit

Skill 可以让智能体执行脚本。安装第三方 Skill 前务必看一遍内容，详见「安全」一课。

SKILL.md

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